I udhëhequr nga një ëndërr e çuditshme, shkencëtari Aki Ross lufton për të mbledhur tetë shpirtrat me shpresën për të krijuar një forcë mjaft të fuqishme për të mbrojtur planetin. Me ndihmën e skuadronit Deep Eyes dhe mentorit të saj, Dr. Sid, Aki duhet të shpëtojë Tokën nga urrejtja e saj më e errët dhe të çlirojë shpirtrat brenda.