Një alkimist i arratisur me aftësi misterioze i çon vëllezërit Elrik në një luginë të largët të lagjeve të varfëra të banuara nga Milos, një popull krenar që lufton kundër shfrytëzimit burokratik. Ed dhe Al e gjejnë veten shpejt në mes të një rebelimi në rritje, ndërsa Milos i mërguar sulmon shtypësit e tyre. Në qendër të konfliktit është Julia, një alkimiste e re e miqësuar nga Alphonse. Ajo nuk do të ndalet në asgjë për t'i rikthyer Milos në lavdinë e tyre të mëparshme - edhe nëse kjo do të thotë të shfrytëzojë fuqinë e tmerrshme të Gurit të Filozofit mitik.