Jackson është kthyer, dhe tani ai ka një partner të ri, kampionin e karatesë Sean, pasi ata duhet të përballen me një terrorist vdekjeprurës të njohur si "The Cobra", i cili e ka infektuar Sean me një virus. Sean dhe Jackson nuk kanë zgjidhje tjetër veçse të luftojnë Kobrën dhe grupet e tij të ninjave.