Ash dhe miqtë (këtë herë të shoqëruar nga Agimi i sapoardhur) mbërrijnë në një fshat idilik në rrugën e tyre për në konkursin e tyre të radhës Pokemon, ku kaosi do të shpërthejë së shpejti me profecinë e dy perëndive të Pokemonit (Dialga dhe Palkia) dhe ardhjen e një Pokemon misterioz, në dukje vdekjeprurës të quajtur Darkrai, i cili ka fuqinë për të shtrembëruar hapësirën dhe kohën.